1. есть весьма средней кривости и удобства avidemux - только не особо сохраняет настройки, не особо дружит с XviD и порой вылетает.2. как уже сказали - mencoderпользую сам. отличнейшая вещь. советую осилить ман.могу выложить примеры скриптов, правда, в инете много их, и гораздо более автоматизирующих работу