Если так критично, чтобы без твоего пароля не загрузили систему, кто мешает поставить программу TrueCrypt ?Она есть как под винду, так и под линь.Ею можно зашифровать как отдельно что то, так и целый раздел диска, и в том числе можно зашифровать системный раздел (загрузочный). И вот тут уж без знания пароля, загрузился ты с лайвСД или хоть из космоса - без пароля ничего не увидишь, потому что вся инфа зашифрована. И никакой флэхи не надо (которая однажды потеряется или просто помрет и ты сам не получишь доступ к диску никогда).
Трукрипт, к сожалению, линуксовские разделы не шифрует пока.Может на них только файлы-криптоконтейнеры делать.А для виндовсов программа отличная, это точно (сам пользуюсь:)Но у линукса своих шифрований, вроде, есть несколько вариантов.Но, может, в данном случае достаточно просто груб именно на эту флешку поставить, а не на ХДД?