Вообще, не понимаю, зачем чего-то сносить и ставить заново? Привычка, оставшаяся от винды? Для переустановки достаточно просто снести те пакеты, которые мешают жить, почистить логи, грохнуть кеши, запустить апдейт, установить те пакеты, которые были снесены, поправить (восстановить) конфиги. Все.ЗЫ: Вообще, научитесь бакапить конфиги .
Кстати, а как сделать, чтобы кеш не вытирался периодически? Чтобы все, что скачано, оставалось там до того момента, пока не будет произведена ручная очистка кеша .